Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX76

CMTM6, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM6Q9NX76 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CMTM6Q9NX76 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CMTM6Q9NX76 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CMTM6Q9NX76 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CMTM6Q9NX76 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CMTM6Q9NX76 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CMTM6Q9NX76 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CMTM6Q9NX76 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CMTM6Q9NX76 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CMTM6Q9NX76 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CMTM6Q9NX76 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CMTM6Q9NX76 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CMTM6Q9NX76 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CMTM6Q9NX76 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CMTM6Q9NX76 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CMTM6Q9NX76 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CMTM6Q9NX76 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CMTM6Q9NX76 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CMTM6Q9NX76 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CMTM6Q9NX76 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CMTM6Q9NX76 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CMTM6Q9NX76 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CMTM6Q9NX76 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CMTM6Q9NX76 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CMTM6Q9NX76 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CMTM6Q9NX76 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CMTM6Q9NX76 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CMTM6Q9NX76 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CMTM6Q9NX76 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CMTM6Q9NX76 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CMTM6Q9NX76 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CMTM6Q9NX76 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CMTM6Q9NX76 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CMTM6Q9NX76 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CMTM6Q9NX76 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CMTM6Q9NX76 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CMTM6Q9NX76 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CMTM6Q9NX76 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CMTM6Q9NX76 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CMTM6Q9NX76 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CMTM6Q9NX76 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CMTM6Q9NX76 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CMTM6Q9NX76 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CMTM6Q9NX76 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CMTM6Q9NX76 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CMTM6Q9NX76 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CMTM6Q9NX76 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CMTM6Q9NX76 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CMTM6Q9NX76 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CMTM6Q9NX76 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CMTM6Q9NX76 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CMTM6Q9NX76 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CMTM6Q9NX76 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CMTM6Q9NX76 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CMTM6Q9NX76 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CMTM6Q9NX76 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CMTM6Q9NX76 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CMTM6Q9NX76 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CMTM6Q9NX76 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CMTM6Q9NX76 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CMTM6Q9NX76 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CMTM6Q9NX76 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CMTM6Q9NX76 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CMTM6Q9NX76 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CMTM6Q9NX76 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CMTM6Q9NX76 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CMTM6Q9NX76 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CMTM6Q9NX76 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CMTM6Q9NX76 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CMTM6Q9NX76 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CMTM6Q9NX76 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CMTM6Q9NX76 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CMTM6Q9NX76 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CMTM6Q9NX76 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CMTM6Q9NX76 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CMTM6Q9NX76 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CMTM6Q9NX76 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CMTM6Q9NX76 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CMTM6Q9NX76 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CMTM6Q9NX76 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CMTM6Q9NX76 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CMTM6Q9NX76 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CMTM6Q9NX76 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CMTM6Q9NX76 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CMTM6Q9NX76 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CMTM6Q9NX76 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CMTM6Q9NX76 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CMTM6Q9NX76 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CMTM6Q9NX76 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CMTM6Q9NX76 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CMTM6Q9NX76 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CMTM6Q9NX76 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CMTM6Q9NX76 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CMTM6Q9NX76 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CMTM6Q9NX76 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CMTM6Q9NX76 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CMTM6Q9NX76 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CMTM6Q9NX76 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CMTM6Q9NX76 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CMTM6Q9NX76 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms