Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GINM1Q9NU53 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GINM1Q9NU53 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GINM1Q9NU53 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GINM1Q9NU53 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GINM1Q9NU53 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GINM1Q9NU53 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GINM1Q9NU53 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GINM1Q9NU53 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GINM1Q9NU53 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GINM1Q9NU53 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GINM1Q9NU53 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GINM1Q9NU53 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GINM1Q9NU53 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GINM1Q9NU53 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GINM1Q9NU53 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GINM1Q9NU53 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GINM1Q9NU53 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GINM1Q9NU53 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GINM1Q9NU53 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GINM1Q9NU53 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GINM1Q9NU53 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GINM1Q9NU53 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GINM1Q9NU53 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GINM1Q9NU53 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GINM1Q9NU53 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GINM1Q9NU53 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GINM1Q9NU53 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GINM1Q9NU53 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GINM1Q9NU53 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GINM1Q9NU53 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GINM1Q9NU53 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GINM1Q9NU53 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GINM1Q9NU53 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GINM1Q9NU53 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GINM1Q9NU53 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GINM1Q9NU53 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GINM1Q9NU53 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GINM1Q9NU53 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GINM1Q9NU53 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GINM1Q9NU53 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GINM1Q9NU53 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GINM1Q9NU53 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GINM1Q9NU53 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GINM1Q9NU53 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GINM1Q9NU53 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GINM1Q9NU53 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GINM1Q9NU53 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GINM1Q9NU53 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GINM1Q9NU53 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GINM1Q9NU53 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GINM1Q9NU53 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GINM1Q9NU53 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GINM1Q9NU53 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GINM1Q9NU53 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GINM1Q9NU53 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GINM1Q9NU53 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GINM1Q9NU53 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GINM1Q9NU53 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GINM1Q9NU53 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GINM1Q9NU53 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GINM1Q9NU53 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GINM1Q9NU53 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GINM1Q9NU53 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GINM1Q9NU53 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GINM1Q9NU53 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GINM1Q9NU53 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GINM1Q9NU53 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GINM1Q9NU53 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GINM1Q9NU53 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GINM1Q9NU53 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GINM1Q9NU53 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GINM1Q9NU53 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GINM1Q9NU53 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GINM1Q9NU53 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GINM1Q9NU53 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GINM1Q9NU53 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GINM1Q9NU53 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GINM1Q9NU53 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GINM1Q9NU53 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GINM1Q9NU53 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GINM1Q9NU53 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GINM1Q9NU53 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GINM1Q9NU53 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GINM1Q9NU53 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GINM1Q9NU53 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GINM1Q9NU53 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GINM1Q9NU53 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GINM1Q9NU53 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GINM1Q9NU53 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GINM1Q9NU53 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GINM1Q9NU53 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GINM1Q9NU53 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GINM1Q9NU53 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GINM1Q9NU53 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GINM1Q9NU53 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GINM1Q9NU53 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GINM1Q9NU53 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GINM1Q9NU53 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GINM1Q9NU53 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms