Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPMQ9NSP4 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms