Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX2

MRPL17, 39S ribosomal protein L17, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL17Q9NRX2 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPL17Q9NRX2 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPL17Q9NRX2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPL17Q9NRX2 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPL17Q9NRX2 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPL17Q9NRX2 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPL17Q9NRX2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPL17Q9NRX2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPL17Q9NRX2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPL17Q9NRX2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPL17Q9NRX2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPL17Q9NRX2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPL17Q9NRX2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPL17Q9NRX2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPL17Q9NRX2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPL17Q9NRX2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPL17Q9NRX2 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPL17Q9NRX2 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPL17Q9NRX2 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPL17Q9NRX2 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPL17Q9NRX2 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPL17Q9NRX2 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPL17Q9NRX2 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPL17Q9NRX2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPL17Q9NRX2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPL17Q9NRX2 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPL17Q9NRX2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPL17Q9NRX2 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPL17Q9NRX2 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPL17Q9NRX2 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPL17Q9NRX2 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPL17Q9NRX2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPL17Q9NRX2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPL17Q9NRX2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPL17Q9NRX2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPL17Q9NRX2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPL17Q9NRX2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPL17Q9NRX2 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPL17Q9NRX2 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPL17Q9NRX2 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPL17Q9NRX2 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPL17Q9NRX2 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPL17Q9NRX2 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPL17Q9NRX2 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPL17Q9NRX2 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPL17Q9NRX2 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPL17Q9NRX2 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPL17Q9NRX2 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPL17Q9NRX2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPL17Q9NRX2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPL17Q9NRX2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPL17Q9NRX2 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPL17Q9NRX2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPL17Q9NRX2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPL17Q9NRX2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPL17Q9NRX2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPL17Q9NRX2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPL17Q9NRX2 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPL17Q9NRX2 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPL17Q9NRX2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPL17Q9NRX2 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPL17Q9NRX2 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPL17Q9NRX2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPL17Q9NRX2 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPL17Q9NRX2 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPL17Q9NRX2 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPL17Q9NRX2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPL17Q9NRX2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPL17Q9NRX2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPL17Q9NRX2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPL17Q9NRX2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPL17Q9NRX2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPL17Q9NRX2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPL17Q9NRX2 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPL17Q9NRX2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPL17Q9NRX2 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPL17Q9NRX2 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPL17Q9NRX2 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPL17Q9NRX2 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPL17Q9NRX2 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPL17Q9NRX2 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPL17Q9NRX2 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPL17Q9NRX2 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPL17Q9NRX2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPL17Q9NRX2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPL17Q9NRX2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPL17Q9NRX2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPL17Q9NRX2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPL17Q9NRX2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPL17Q9NRX2 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPL17Q9NRX2 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPL17Q9NRX2 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPL17Q9NRX2 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPL17Q9NRX2 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPL17Q9NRX2 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPL17Q9NRX2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPL17Q9NRX2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPL17Q9NRX2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPL17Q9NRX2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPL17Q9NRX2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms