Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMPRSS4Q9NRS4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMPRSS4Q9NRS4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMPRSS4Q9NRS4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMPRSS4Q9NRS4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMPRSS4Q9NRS4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMPRSS4Q9NRS4 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMPRSS4Q9NRS4 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMPRSS4Q9NRS4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMPRSS4Q9NRS4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMPRSS4Q9NRS4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMPRSS4Q9NRS4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMPRSS4Q9NRS4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMPRSS4Q9NRS4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMPRSS4Q9NRS4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMPRSS4Q9NRS4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMPRSS4Q9NRS4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMPRSS4Q9NRS4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMPRSS4Q9NRS4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TMPRSS4Q9NRS4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TMPRSS4Q9NRS4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMPRSS4Q9NRS4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMPRSS4Q9NRS4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMPRSS4Q9NRS4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMPRSS4Q9NRS4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMPRSS4Q9NRS4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMPRSS4Q9NRS4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMPRSS4Q9NRS4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMPRSS4Q9NRS4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMPRSS4Q9NRS4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMPRSS4Q9NRS4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMPRSS4Q9NRS4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMPRSS4Q9NRS4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TMPRSS4Q9NRS4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TMPRSS4Q9NRS4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMPRSS4Q9NRS4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMPRSS4Q9NRS4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TMPRSS4Q9NRS4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMPRSS4Q9NRS4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMPRSS4Q9NRS4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMPRSS4Q9NRS4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMPRSS4Q9NRS4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMPRSS4Q9NRS4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMPRSS4Q9NRS4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMPRSS4Q9NRS4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMPRSS4Q9NRS4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMPRSS4Q9NRS4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMPRSS4Q9NRS4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMPRSS4Q9NRS4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMPRSS4Q9NRS4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMPRSS4Q9NRS4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMPRSS4Q9NRS4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMPRSS4Q9NRS4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMPRSS4Q9NRS4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMPRSS4Q9NRS4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMPRSS4Q9NRS4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMPRSS4Q9NRS4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMPRSS4Q9NRS4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMPRSS4Q9NRS4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMPRSS4Q9NRS4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMPRSS4Q9NRS4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMPRSS4Q9NRS4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMPRSS4Q9NRS4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMPRSS4Q9NRS4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMPRSS4Q9NRS4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMPRSS4Q9NRS4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMPRSS4Q9NRS4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMPRSS4Q9NRS4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMPRSS4Q9NRS4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TMPRSS4Q9NRS4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMPRSS4Q9NRS4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMPRSS4Q9NRS4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMPRSS4Q9NRS4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMPRSS4Q9NRS4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMPRSS4Q9NRS4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMPRSS4Q9NRS4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMPRSS4Q9NRS4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMPRSS4Q9NRS4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMPRSS4Q9NRS4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMPRSS4Q9NRS4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMPRSS4Q9NRS4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMPRSS4Q9NRS4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMPRSS4Q9NRS4 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMPRSS4Q9NRS4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMPRSS4Q9NRS4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMPRSS4Q9NRS4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMPRSS4Q9NRS4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMPRSS4Q9NRS4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMPRSS4Q9NRS4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMPRSS4Q9NRS4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMPRSS4Q9NRS4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMPRSS4Q9NRS4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMPRSS4Q9NRS4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMPRSS4Q9NRS4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms