Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC3

RTN4, Reticulon-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4Q9NQC3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTN4Q9NQC3 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTN4Q9NQC3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTN4Q9NQC3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTN4Q9NQC3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTN4Q9NQC3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTN4Q9NQC3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTN4Q9NQC3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTN4Q9NQC3 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTN4Q9NQC3 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTN4Q9NQC3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTN4Q9NQC3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTN4Q9NQC3 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTN4Q9NQC3 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTN4Q9NQC3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTN4Q9NQC3 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTN4Q9NQC3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTN4Q9NQC3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTN4Q9NQC3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTN4Q9NQC3 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTN4Q9NQC3 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTN4Q9NQC3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTN4Q9NQC3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTN4Q9NQC3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTN4Q9NQC3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTN4Q9NQC3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTN4Q9NQC3 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTN4Q9NQC3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTN4Q9NQC3 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTN4Q9NQC3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTN4Q9NQC3 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTN4Q9NQC3 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTN4Q9NQC3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTN4Q9NQC3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTN4Q9NQC3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTN4Q9NQC3 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTN4Q9NQC3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTN4Q9NQC3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTN4Q9NQC3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTN4Q9NQC3 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTN4Q9NQC3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTN4Q9NQC3 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTN4Q9NQC3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTN4Q9NQC3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTN4Q9NQC3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTN4Q9NQC3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTN4Q9NQC3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTN4Q9NQC3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTN4Q9NQC3 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTN4Q9NQC3 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTN4Q9NQC3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RTN4Q9NQC3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTN4Q9NQC3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTN4Q9NQC3 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTN4Q9NQC3 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTN4Q9NQC3 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTN4Q9NQC3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTN4Q9NQC3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTN4Q9NQC3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RTN4Q9NQC3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTN4Q9NQC3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTN4Q9NQC3 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTN4Q9NQC3 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTN4Q9NQC3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTN4Q9NQC3 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTN4Q9NQC3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTN4Q9NQC3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTN4Q9NQC3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTN4Q9NQC3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTN4Q9NQC3 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTN4Q9NQC3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RTN4Q9NQC3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTN4Q9NQC3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTN4Q9NQC3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTN4Q9NQC3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTN4Q9NQC3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTN4Q9NQC3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTN4Q9NQC3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTN4Q9NQC3 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTN4Q9NQC3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RTN4Q9NQC3 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RTN4Q9NQC3 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RTN4Q9NQC3 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RTN4Q9NQC3 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RTN4Q9NQC3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RTN4Q9NQC3 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RTN4Q9NQC3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RTN4Q9NQC3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RTN4Q9NQC3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RTN4Q9NQC3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RTN4Q9NQC3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RTN4Q9NQC3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RTN4Q9NQC3 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RTN4Q9NQC3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RTN4Q9NQC3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RTN4Q9NQC3 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RTN4Q9NQC3 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RTN4Q9NQC3 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RTN4Q9NQC3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RTN4Q9NQC3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms