Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ03

SCRT2, Transcriptional repressor scratch 2, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCRT2Q9NQ03 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCRT2Q9NQ03 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCRT2Q9NQ03 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCRT2Q9NQ03 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCRT2Q9NQ03 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCRT2Q9NQ03 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCRT2Q9NQ03 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCRT2Q9NQ03 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCRT2Q9NQ03 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCRT2Q9NQ03 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCRT2Q9NQ03 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCRT2Q9NQ03 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCRT2Q9NQ03 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCRT2Q9NQ03 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCRT2Q9NQ03 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCRT2Q9NQ03 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCRT2Q9NQ03 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCRT2Q9NQ03 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCRT2Q9NQ03 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCRT2Q9NQ03 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCRT2Q9NQ03 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCRT2Q9NQ03 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCRT2Q9NQ03 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCRT2Q9NQ03 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCRT2Q9NQ03 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCRT2Q9NQ03 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SCRT2Q9NQ03 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCRT2Q9NQ03 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCRT2Q9NQ03 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCRT2Q9NQ03 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCRT2Q9NQ03 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCRT2Q9NQ03 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCRT2Q9NQ03 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCRT2Q9NQ03 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCRT2Q9NQ03 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCRT2Q9NQ03 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCRT2Q9NQ03 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCRT2Q9NQ03 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCRT2Q9NQ03 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCRT2Q9NQ03 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCRT2Q9NQ03 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCRT2Q9NQ03 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCRT2Q9NQ03 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCRT2Q9NQ03 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCRT2Q9NQ03 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCRT2Q9NQ03 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCRT2Q9NQ03 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCRT2Q9NQ03 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCRT2Q9NQ03 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCRT2Q9NQ03 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCRT2Q9NQ03 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SCRT2Q9NQ03 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCRT2Q9NQ03 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCRT2Q9NQ03 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCRT2Q9NQ03 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCRT2Q9NQ03 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCRT2Q9NQ03 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCRT2Q9NQ03 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCRT2Q9NQ03 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCRT2Q9NQ03 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCRT2Q9NQ03 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCRT2Q9NQ03 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCRT2Q9NQ03 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCRT2Q9NQ03 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCRT2Q9NQ03 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCRT2Q9NQ03 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCRT2Q9NQ03 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCRT2Q9NQ03 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCRT2Q9NQ03 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCRT2Q9NQ03 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCRT2Q9NQ03 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCRT2Q9NQ03 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCRT2Q9NQ03 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCRT2Q9NQ03 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCRT2Q9NQ03 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCRT2Q9NQ03 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCRT2Q9NQ03 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCRT2Q9NQ03 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCRT2Q9NQ03 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCRT2Q9NQ03 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCRT2Q9NQ03 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCRT2Q9NQ03 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCRT2Q9NQ03 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCRT2Q9NQ03 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCRT2Q9NQ03 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCRT2Q9NQ03 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCRT2Q9NQ03 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCRT2Q9NQ03 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCRT2Q9NQ03 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCRT2Q9NQ03 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCRT2Q9NQ03 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCRT2Q9NQ03 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCRT2Q9NQ03 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCRT2Q9NQ03 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SCRT2Q9NQ03 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms