Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB18Q9NP72 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB18Q9NP72 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB18Q9NP72 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB18Q9NP72 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB18Q9NP72 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB18Q9NP72 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB18Q9NP72 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB18Q9NP72 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB18Q9NP72 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB18Q9NP72 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB18Q9NP72 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB18Q9NP72 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB18Q9NP72 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB18Q9NP72 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB18Q9NP72 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB18Q9NP72 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB18Q9NP72 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB18Q9NP72 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB18Q9NP72 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB18Q9NP72 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB18Q9NP72 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB18Q9NP72 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB18Q9NP72 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB18Q9NP72 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB18Q9NP72 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB18Q9NP72 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB18Q9NP72 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB18Q9NP72 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB18Q9NP72 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB18Q9NP72 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB18Q9NP72 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB18Q9NP72 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB18Q9NP72 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms