Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZCCHC17Q9NP64 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZCCHC17Q9NP64 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZCCHC17Q9NP64 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZCCHC17Q9NP64 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZCCHC17Q9NP64 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZCCHC17Q9NP64 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZCCHC17Q9NP64 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZCCHC17Q9NP64 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZCCHC17Q9NP64 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZCCHC17Q9NP64 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZCCHC17Q9NP64 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZCCHC17Q9NP64 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ZCCHC17Q9NP64 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZCCHC17Q9NP64 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZCCHC17Q9NP64 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms