Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9C1

VIPAS39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIPAS39Q9H9C1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
VIPAS39Q9H9C1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
VIPAS39Q9H9C1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
VIPAS39Q9H9C1 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
VIPAS39Q9H9C1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
VIPAS39Q9H9C1 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VIPAS39Q9H9C1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VIPAS39Q9H9C1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VIPAS39Q9H9C1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VIPAS39Q9H9C1 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VIPAS39Q9H9C1 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VIPAS39Q9H9C1 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VIPAS39Q9H9C1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VIPAS39Q9H9C1 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VIPAS39Q9H9C1 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VIPAS39Q9H9C1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VIPAS39Q9H9C1 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VIPAS39Q9H9C1 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VIPAS39Q9H9C1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VIPAS39Q9H9C1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VIPAS39Q9H9C1 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VIPAS39Q9H9C1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VIPAS39Q9H9C1 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VIPAS39Q9H9C1 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
VIPAS39Q9H9C1 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VIPAS39Q9H9C1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VIPAS39Q9H9C1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VIPAS39Q9H9C1 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VIPAS39Q9H9C1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VIPAS39Q9H9C1 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VIPAS39Q9H9C1 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VIPAS39Q9H9C1 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VIPAS39Q9H9C1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VIPAS39Q9H9C1 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VIPAS39Q9H9C1 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VIPAS39Q9H9C1 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VIPAS39Q9H9C1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VIPAS39Q9H9C1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VIPAS39Q9H9C1 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VIPAS39Q9H9C1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VIPAS39Q9H9C1 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VIPAS39Q9H9C1 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VIPAS39Q9H9C1 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VIPAS39Q9H9C1 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VIPAS39Q9H9C1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VIPAS39Q9H9C1 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VIPAS39Q9H9C1 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VIPAS39Q9H9C1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
VIPAS39Q9H9C1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VIPAS39Q9H9C1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VIPAS39Q9H9C1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VIPAS39Q9H9C1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VIPAS39Q9H9C1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VIPAS39Q9H9C1 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VIPAS39Q9H9C1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VIPAS39Q9H9C1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VIPAS39Q9H9C1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VIPAS39Q9H9C1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VIPAS39Q9H9C1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VIPAS39Q9H9C1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VIPAS39Q9H9C1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VIPAS39Q9H9C1 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VIPAS39Q9H9C1 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VIPAS39Q9H9C1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VIPAS39Q9H9C1 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VIPAS39Q9H9C1 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VIPAS39Q9H9C1 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VIPAS39Q9H9C1 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VIPAS39Q9H9C1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VIPAS39Q9H9C1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VIPAS39Q9H9C1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VIPAS39Q9H9C1 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VIPAS39Q9H9C1 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VIPAS39Q9H9C1 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VIPAS39Q9H9C1 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VIPAS39Q9H9C1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VIPAS39Q9H9C1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VIPAS39Q9H9C1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
VIPAS39Q9H9C1 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VIPAS39Q9H9C1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VIPAS39Q9H9C1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VIPAS39Q9H9C1 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VIPAS39Q9H9C1 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VIPAS39Q9H9C1 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VIPAS39Q9H9C1 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VIPAS39Q9H9C1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VIPAS39Q9H9C1 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VIPAS39Q9H9C1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VIPAS39Q9H9C1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VIPAS39Q9H9C1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VIPAS39Q9H9C1 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
VIPAS39Q9H9C1 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VIPAS39Q9H9C1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VIPAS39Q9H9C1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VIPAS39Q9H9C1 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VIPAS39Q9H9C1 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VIPAS39Q9H9C1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VIPAS39Q9H9C1 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VIPAS39Q9H9C1 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VIPAS39Q9H9C1 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms