Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7B2

RPF2, Ribosome production factor 2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPF2Q9H7B2 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPF2Q9H7B2 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms