Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SENP3Q9H4L4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SENP3Q9H4L4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SENP3Q9H4L4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SENP3Q9H4L4 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SENP3Q9H4L4 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SENP3Q9H4L4 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SENP3Q9H4L4 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SENP3Q9H4L4 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SENP3Q9H4L4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SENP3Q9H4L4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SENP3Q9H4L4 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SENP3Q9H4L4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SENP3Q9H4L4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SENP3Q9H4L4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SENP3Q9H4L4 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SENP3Q9H4L4 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SENP3Q9H4L4 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SENP3Q9H4L4 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SENP3Q9H4L4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SENP3Q9H4L4 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
SENP3Q9H4L4 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SENP3Q9H4L4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SENP3Q9H4L4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SENP3Q9H4L4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SENP3Q9H4L4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SENP3Q9H4L4 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SENP3Q9H4L4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SENP3Q9H4L4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SENP3Q9H4L4 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
SENP3Q9H4L4 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SENP3Q9H4L4 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SENP3Q9H4L4 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
SENP3Q9H4L4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SENP3Q9H4L4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SENP3Q9H4L4 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SENP3Q9H4L4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SENP3Q9H4L4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SENP3Q9H4L4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SENP3Q9H4L4 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SENP3Q9H4L4 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SENP3Q9H4L4 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SENP3Q9H4L4 AC099542.2-201ENST00000474149 553 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SENP3Q9H4L4 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SENP3Q9H4L4 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SENP3Q9H4L4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SENP3Q9H4L4 AC079298.3-201ENST00000624941 977 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SENP3Q9H4L4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SENP3Q9H4L4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SENP3Q9H4L4 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SENP3Q9H4L4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
SENP3Q9H4L4 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SENP3Q9H4L4 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SENP3Q9H4L4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SENP3Q9H4L4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SENP3Q9H4L4 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SENP3Q9H4L4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SENP3Q9H4L4 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SENP3Q9H4L4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
SENP3Q9H4L4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
SENP3Q9H4L4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SENP3Q9H4L4 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SENP3Q9H4L4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SENP3Q9H4L4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SENP3Q9H4L4 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SENP3Q9H4L4 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SENP3Q9H4L4 TBCA-202ENST00000380377 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SENP3Q9H4L4 AL031429.1-201ENST00000426775 749 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SENP3Q9H4L4 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SENP3Q9H4L4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
SENP3Q9H4L4 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SENP3Q9H4L4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SENP3Q9H4L4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SENP3Q9H4L4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SENP3Q9H4L4 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SENP3Q9H4L4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SENP3Q9H4L4 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SENP3Q9H4L4 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SENP3Q9H4L4 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SENP3Q9H4L4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SENP3Q9H4L4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SENP3Q9H4L4 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SENP3Q9H4L4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SENP3Q9H4L4 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
SENP3Q9H4L4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SENP3Q9H4L4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SENP3Q9H4L4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SENP3Q9H4L4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SENP3Q9H4L4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SENP3Q9H4L4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SENP3Q9H4L4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SENP3Q9H4L4 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SENP3Q9H4L4 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
SENP3Q9H4L4 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SENP3Q9H4L4 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
SENP3Q9H4L4 SYNJ2BP-COX16-205ENST00000621525 929 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SENP3Q9H4L4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
SENP3Q9H4L4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SENP3Q9H4L4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SENP3Q9H4L4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms