Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4I3

TRABD, TraB domain-containing protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRABDQ9H4I3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TRABDQ9H4I3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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