Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C1

LHX5, LIM/homeobox protein Lhx5, humanhuman

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Length 402 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX5Q9H2C1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LHX5Q9H2C1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LHX5Q9H2C1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LHX5Q9H2C1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LHX5Q9H2C1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LHX5Q9H2C1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LHX5Q9H2C1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LHX5Q9H2C1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LHX5Q9H2C1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LHX5Q9H2C1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LHX5Q9H2C1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LHX5Q9H2C1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LHX5Q9H2C1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LHX5Q9H2C1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LHX5Q9H2C1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LHX5Q9H2C1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LHX5Q9H2C1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LHX5Q9H2C1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LHX5Q9H2C1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LHX5Q9H2C1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LHX5Q9H2C1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LHX5Q9H2C1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LHX5Q9H2C1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LHX5Q9H2C1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LHX5Q9H2C1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LHX5Q9H2C1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LHX5Q9H2C1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LHX5Q9H2C1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LHX5Q9H2C1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LHX5Q9H2C1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LHX5Q9H2C1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LHX5Q9H2C1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LHX5Q9H2C1 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LHX5Q9H2C1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LHX5Q9H2C1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LHX5Q9H2C1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LHX5Q9H2C1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LHX5Q9H2C1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LHX5Q9H2C1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LHX5Q9H2C1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LHX5Q9H2C1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LHX5Q9H2C1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LHX5Q9H2C1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LHX5Q9H2C1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LHX5Q9H2C1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LHX5Q9H2C1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LHX5Q9H2C1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LHX5Q9H2C1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LHX5Q9H2C1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LHX5Q9H2C1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LHX5Q9H2C1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
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