Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0I3

CCDC113, Coiled-coil domain-containing protein 113, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC113Q9H0I3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC113Q9H0I3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC113Q9H0I3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC113Q9H0I3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC113Q9H0I3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC113Q9H0I3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC113Q9H0I3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC113Q9H0I3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC113Q9H0I3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC113Q9H0I3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC113Q9H0I3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC113Q9H0I3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC113Q9H0I3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC113Q9H0I3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC113Q9H0I3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC113Q9H0I3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC113Q9H0I3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC113Q9H0I3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC113Q9H0I3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC113Q9H0I3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC113Q9H0I3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC113Q9H0I3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC113Q9H0I3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms