Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms