Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.29■■□□□ 1
POLR1EQ9GZS1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR1EQ9GZS1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR1EQ9GZS1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR1EQ9GZS1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR1EQ9GZS1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR1EQ9GZS1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR1EQ9GZS1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR1EQ9GZS1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
POLR1EQ9GZS1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR1EQ9GZS1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
POLR1EQ9GZS1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
POLR1EQ9GZS1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.28■■□□□ 1
POLR1EQ9GZS1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
POLR1EQ9GZS1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
POLR1EQ9GZS1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR1EQ9GZS1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR1EQ9GZS1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR1EQ9GZS1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR1EQ9GZS1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
POLR1EQ9GZS1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR1EQ9GZS1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR1EQ9GZS1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
POLR1EQ9GZS1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR1EQ9GZS1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
POLR1EQ9GZS1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
POLR1EQ9GZS1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
POLR1EQ9GZS1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR1EQ9GZS1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR1EQ9GZS1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR1EQ9GZS1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR1EQ9GZS1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR1EQ9GZS1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR1EQ9GZS1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR1EQ9GZS1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR1EQ9GZS1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR1EQ9GZS1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR1EQ9GZS1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR1EQ9GZS1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR1EQ9GZS1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR1EQ9GZS1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR1EQ9GZS1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR1EQ9GZS1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR1EQ9GZS1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR1EQ9GZS1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR1EQ9GZS1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR1EQ9GZS1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR1EQ9GZS1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR1EQ9GZS1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR1EQ9GZS1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR1EQ9GZS1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR1EQ9GZS1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR1EQ9GZS1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR1EQ9GZS1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR1EQ9GZS1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR1EQ9GZS1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR1EQ9GZS1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR1EQ9GZS1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR1EQ9GZS1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR1EQ9GZS1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR1EQ9GZS1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR1EQ9GZS1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR1EQ9GZS1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR1EQ9GZS1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR1EQ9GZS1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR1EQ9GZS1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR1EQ9GZS1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR1EQ9GZS1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR1EQ9GZS1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR1EQ9GZS1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR1EQ9GZS1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR1EQ9GZS1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR1EQ9GZS1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR1EQ9GZS1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR1EQ9GZS1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR1EQ9GZS1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR1EQ9GZS1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR1EQ9GZS1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR1EQ9GZS1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR1EQ9GZS1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR1EQ9GZS1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR1EQ9GZS1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR1EQ9GZS1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR1EQ9GZS1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR1EQ9GZS1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR1EQ9GZS1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR1EQ9GZS1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR1EQ9GZS1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR1EQ9GZS1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR1EQ9GZS1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR1EQ9GZS1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR1EQ9GZS1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR1EQ9GZS1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR1EQ9GZS1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR1EQ9GZS1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR1EQ9GZS1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR1EQ9GZS1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR1EQ9GZS1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR1EQ9GZS1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR1EQ9GZS1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms