Protein–RNA interactions for Protein: Q9C075

KRT23, Keratin, type I cytoskeletal 23, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT23Q9C075 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT23Q9C075 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT23Q9C075 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT23Q9C075 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT23Q9C075 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT23Q9C075 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT23Q9C075 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT23Q9C075 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT23Q9C075 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT23Q9C075 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT23Q9C075 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT23Q9C075 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT23Q9C075 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT23Q9C075 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT23Q9C075 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT23Q9C075 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT23Q9C075 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT23Q9C075 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT23Q9C075 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT23Q9C075 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT23Q9C075 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT23Q9C075 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT23Q9C075 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT23Q9C075 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT23Q9C075 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT23Q9C075 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT23Q9C075 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT23Q9C075 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT23Q9C075 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT23Q9C075 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT23Q9C075 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT23Q9C075 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT23Q9C075 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT23Q9C075 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT23Q9C075 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT23Q9C075 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT23Q9C075 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT23Q9C075 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT23Q9C075 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT23Q9C075 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT23Q9C075 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT23Q9C075 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT23Q9C075 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT23Q9C075 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT23Q9C075 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT23Q9C075 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT23Q9C075 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT23Q9C075 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT23Q9C075 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT23Q9C075 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT23Q9C075 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT23Q9C075 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT23Q9C075 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT23Q9C075 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT23Q9C075 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT23Q9C075 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT23Q9C075 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT23Q9C075 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT23Q9C075 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
KRT23Q9C075 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KRT23Q9C075 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT23Q9C075 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT23Q9C075 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT23Q9C075 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT23Q9C075 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT23Q9C075 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT23Q9C075 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT23Q9C075 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT23Q9C075 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT23Q9C075 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT23Q9C075 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT23Q9C075 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT23Q9C075 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT23Q9C075 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT23Q9C075 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT23Q9C075 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT23Q9C075 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT23Q9C075 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT23Q9C075 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT23Q9C075 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT23Q9C075 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT23Q9C075 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT23Q9C075 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT23Q9C075 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT23Q9C075 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT23Q9C075 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT23Q9C075 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT23Q9C075 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT23Q9C075 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT23Q9C075 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT23Q9C075 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT23Q9C075 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT23Q9C075 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT23Q9C075 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT23Q9C075 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT23Q9C075 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT23Q9C075 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT23Q9C075 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT23Q9C075 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT23Q9C075 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms