Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM8Q9BZR9 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM8Q9BZR9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM8Q9BZR9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM8Q9BZR9 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM8Q9BZR9 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM8Q9BZR9 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM8Q9BZR9 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM8Q9BZR9 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM8Q9BZR9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM8Q9BZR9 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM8Q9BZR9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM8Q9BZR9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM8Q9BZR9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM8Q9BZR9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM8Q9BZR9 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM8Q9BZR9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM8Q9BZR9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM8Q9BZR9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM8Q9BZR9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM8Q9BZR9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM8Q9BZR9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM8Q9BZR9 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM8Q9BZR9 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM8Q9BZR9 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM8Q9BZR9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM8Q9BZR9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM8Q9BZR9 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM8Q9BZR9 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM8Q9BZR9 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM8Q9BZR9 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM8Q9BZR9 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM8Q9BZR9 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TRIM8Q9BZR9 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TRIM8Q9BZR9 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms