Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL6

PRKD2, Serine/threonine-protein kinase D2, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD2Q9BZL6 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKD2Q9BZL6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKD2Q9BZL6 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKD2Q9BZL6 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKD2Q9BZL6 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKD2Q9BZL6 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKD2Q9BZL6 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKD2Q9BZL6 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKD2Q9BZL6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKD2Q9BZL6 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKD2Q9BZL6 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKD2Q9BZL6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKD2Q9BZL6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKD2Q9BZL6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKD2Q9BZL6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKD2Q9BZL6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKD2Q9BZL6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKD2Q9BZL6 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKD2Q9BZL6 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKD2Q9BZL6 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKD2Q9BZL6 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKD2Q9BZL6 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKD2Q9BZL6 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKD2Q9BZL6 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKD2Q9BZL6 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKD2Q9BZL6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKD2Q9BZL6 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKD2Q9BZL6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKD2Q9BZL6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKD2Q9BZL6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKD2Q9BZL6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKD2Q9BZL6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKD2Q9BZL6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKD2Q9BZL6 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKD2Q9BZL6 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKD2Q9BZL6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKD2Q9BZL6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKD2Q9BZL6 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKD2Q9BZL6 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKD2Q9BZL6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKD2Q9BZL6 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKD2Q9BZL6 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKD2Q9BZL6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKD2Q9BZL6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKD2Q9BZL6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKD2Q9BZL6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRKD2Q9BZL6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRKD2Q9BZL6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRKD2Q9BZL6 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKD2Q9BZL6 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKD2Q9BZL6 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKD2Q9BZL6 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKD2Q9BZL6 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKD2Q9BZL6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKD2Q9BZL6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKD2Q9BZL6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKD2Q9BZL6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKD2Q9BZL6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKD2Q9BZL6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKD2Q9BZL6 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKD2Q9BZL6 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKD2Q9BZL6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKD2Q9BZL6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKD2Q9BZL6 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKD2Q9BZL6 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKD2Q9BZL6 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKD2Q9BZL6 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKD2Q9BZL6 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKD2Q9BZL6 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKD2Q9BZL6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKD2Q9BZL6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKD2Q9BZL6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKD2Q9BZL6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKD2Q9BZL6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKD2Q9BZL6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKD2Q9BZL6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKD2Q9BZL6 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKD2Q9BZL6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKD2Q9BZL6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKD2Q9BZL6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKD2Q9BZL6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKD2Q9BZL6 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKD2Q9BZL6 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKD2Q9BZL6 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKD2Q9BZL6 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKD2Q9BZL6 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKD2Q9BZL6 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKD2Q9BZL6 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKD2Q9BZL6 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKD2Q9BZL6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKD2Q9BZL6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKD2Q9BZL6 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKD2Q9BZL6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKD2Q9BZL6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKD2Q9BZL6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKD2Q9BZL6 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKD2Q9BZL6 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKD2Q9BZL6 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKD2Q9BZL6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKD2Q9BZL6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms