Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZI7

UPF3B, Regulator of nonsense transcripts 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF3BQ9BZI7 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UPF3BQ9BZI7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UPF3BQ9BZI7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UPF3BQ9BZI7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UPF3BQ9BZI7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UPF3BQ9BZI7 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UPF3BQ9BZI7 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UPF3BQ9BZI7 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UPF3BQ9BZI7 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UPF3BQ9BZI7 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UPF3BQ9BZI7 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UPF3BQ9BZI7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UPF3BQ9BZI7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UPF3BQ9BZI7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UPF3BQ9BZI7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UPF3BQ9BZI7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UPF3BQ9BZI7 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UPF3BQ9BZI7 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UPF3BQ9BZI7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UPF3BQ9BZI7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UPF3BQ9BZI7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UPF3BQ9BZI7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UPF3BQ9BZI7 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UPF3BQ9BZI7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UPF3BQ9BZI7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UPF3BQ9BZI7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UPF3BQ9BZI7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
UPF3BQ9BZI7 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UPF3BQ9BZI7 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UPF3BQ9BZI7 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UPF3BQ9BZI7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
UPF3BQ9BZI7 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
UPF3BQ9BZI7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
UPF3BQ9BZI7 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UPF3BQ9BZI7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UPF3BQ9BZI7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UPF3BQ9BZI7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UPF3BQ9BZI7 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UPF3BQ9BZI7 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UPF3BQ9BZI7 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UPF3BQ9BZI7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UPF3BQ9BZI7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UPF3BQ9BZI7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UPF3BQ9BZI7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UPF3BQ9BZI7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UPF3BQ9BZI7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UPF3BQ9BZI7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UPF3BQ9BZI7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UPF3BQ9BZI7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UPF3BQ9BZI7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UPF3BQ9BZI7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UPF3BQ9BZI7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UPF3BQ9BZI7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UPF3BQ9BZI7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
UPF3BQ9BZI7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UPF3BQ9BZI7 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UPF3BQ9BZI7 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UPF3BQ9BZI7 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UPF3BQ9BZI7 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UPF3BQ9BZI7 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UPF3BQ9BZI7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UPF3BQ9BZI7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UPF3BQ9BZI7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UPF3BQ9BZI7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UPF3BQ9BZI7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UPF3BQ9BZI7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UPF3BQ9BZI7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UPF3BQ9BZI7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UPF3BQ9BZI7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UPF3BQ9BZI7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UPF3BQ9BZI7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UPF3BQ9BZI7 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UPF3BQ9BZI7 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
UPF3BQ9BZI7 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UPF3BQ9BZI7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UPF3BQ9BZI7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UPF3BQ9BZI7 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UPF3BQ9BZI7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UPF3BQ9BZI7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UPF3BQ9BZI7 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UPF3BQ9BZI7 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UPF3BQ9BZI7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
UPF3BQ9BZI7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UPF3BQ9BZI7 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
UPF3BQ9BZI7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UPF3BQ9BZI7 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UPF3BQ9BZI7 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UPF3BQ9BZI7 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UPF3BQ9BZI7 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UPF3BQ9BZI7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UPF3BQ9BZI7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UPF3BQ9BZI7 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UPF3BQ9BZI7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UPF3BQ9BZI7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UPF3BQ9BZI7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UPF3BQ9BZI7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UPF3BQ9BZI7 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UPF3BQ9BZI7 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UPF3BQ9BZI7 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UPF3BQ9BZI7 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms