Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GSDMCQ9BYG8 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GSDMCQ9BYG8 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GSDMCQ9BYG8 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
GSDMCQ9BYG8 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GSDMCQ9BYG8 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GSDMCQ9BYG8 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GSDMCQ9BYG8 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
GSDMCQ9BYG8 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GSDMCQ9BYG8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GSDMCQ9BYG8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GSDMCQ9BYG8 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GSDMCQ9BYG8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GSDMCQ9BYG8 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GSDMCQ9BYG8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GSDMCQ9BYG8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GSDMCQ9BYG8 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GSDMCQ9BYG8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GSDMCQ9BYG8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GSDMCQ9BYG8 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GSDMCQ9BYG8 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GSDMCQ9BYG8 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GSDMCQ9BYG8 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GSDMCQ9BYG8 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GSDMCQ9BYG8 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GSDMCQ9BYG8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GSDMCQ9BYG8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GSDMCQ9BYG8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GSDMCQ9BYG8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GSDMCQ9BYG8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GSDMCQ9BYG8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GSDMCQ9BYG8 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GSDMCQ9BYG8 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GSDMCQ9BYG8 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GSDMCQ9BYG8 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GSDMCQ9BYG8 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GSDMCQ9BYG8 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GSDMCQ9BYG8 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GSDMCQ9BYG8 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
GSDMCQ9BYG8 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GSDMCQ9BYG8 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GSDMCQ9BYG8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GSDMCQ9BYG8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GSDMCQ9BYG8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GSDMCQ9BYG8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms