Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT78

COPS4, COP9 signalosome complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS4Q9BT78 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COPS4Q9BT78 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COPS4Q9BT78 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COPS4Q9BT78 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COPS4Q9BT78 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COPS4Q9BT78 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COPS4Q9BT78 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
COPS4Q9BT78 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COPS4Q9BT78 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COPS4Q9BT78 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COPS4Q9BT78 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COPS4Q9BT78 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COPS4Q9BT78 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COPS4Q9BT78 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COPS4Q9BT78 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
COPS4Q9BT78 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COPS4Q9BT78 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COPS4Q9BT78 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COPS4Q9BT78 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COPS4Q9BT78 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COPS4Q9BT78 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COPS4Q9BT78 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COPS4Q9BT78 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
COPS4Q9BT78 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
COPS4Q9BT78 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
COPS4Q9BT78 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
COPS4Q9BT78 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
COPS4Q9BT78 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
COPS4Q9BT78 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms