Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW7

SYT17, Synaptotagmin-17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT17Q9BSW7 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SYT17Q9BSW7 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYT17Q9BSW7 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYT17Q9BSW7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYT17Q9BSW7 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYT17Q9BSW7 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYT17Q9BSW7 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYT17Q9BSW7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYT17Q9BSW7 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYT17Q9BSW7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYT17Q9BSW7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYT17Q9BSW7 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYT17Q9BSW7 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYT17Q9BSW7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYT17Q9BSW7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYT17Q9BSW7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYT17Q9BSW7 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYT17Q9BSW7 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SYT17Q9BSW7 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYT17Q9BSW7 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYT17Q9BSW7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYT17Q9BSW7 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYT17Q9BSW7 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SYT17Q9BSW7 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYT17Q9BSW7 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYT17Q9BSW7 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SYT17Q9BSW7 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYT17Q9BSW7 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYT17Q9BSW7 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYT17Q9BSW7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYT17Q9BSW7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYT17Q9BSW7 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYT17Q9BSW7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYT17Q9BSW7 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYT17Q9BSW7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYT17Q9BSW7 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYT17Q9BSW7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYT17Q9BSW7 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYT17Q9BSW7 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYT17Q9BSW7 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYT17Q9BSW7 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SYT17Q9BSW7 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYT17Q9BSW7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYT17Q9BSW7 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYT17Q9BSW7 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYT17Q9BSW7 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYT17Q9BSW7 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYT17Q9BSW7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYT17Q9BSW7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYT17Q9BSW7 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYT17Q9BSW7 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYT17Q9BSW7 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYT17Q9BSW7 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYT17Q9BSW7 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYT17Q9BSW7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SYT17Q9BSW7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SYT17Q9BSW7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SYT17Q9BSW7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SYT17Q9BSW7 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SYT17Q9BSW7 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SYT17Q9BSW7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYT17Q9BSW7 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYT17Q9BSW7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYT17Q9BSW7 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYT17Q9BSW7 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYT17Q9BSW7 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYT17Q9BSW7 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYT17Q9BSW7 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SYT17Q9BSW7 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYT17Q9BSW7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYT17Q9BSW7 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYT17Q9BSW7 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYT17Q9BSW7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYT17Q9BSW7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYT17Q9BSW7 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYT17Q9BSW7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYT17Q9BSW7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYT17Q9BSW7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYT17Q9BSW7 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYT17Q9BSW7 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYT17Q9BSW7 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYT17Q9BSW7 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYT17Q9BSW7 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SYT17Q9BSW7 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYT17Q9BSW7 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYT17Q9BSW7 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYT17Q9BSW7 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYT17Q9BSW7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYT17Q9BSW7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYT17Q9BSW7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYT17Q9BSW7 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYT17Q9BSW7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYT17Q9BSW7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYT17Q9BSW7 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SYT17Q9BSW7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYT17Q9BSW7 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYT17Q9BSW7 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYT17Q9BSW7 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYT17Q9BSW7 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYT17Q9BSW7 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms