Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSK0

MARVELD1, MARVEL domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARVELD1Q9BSK0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MARVELD1Q9BSK0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MARVELD1Q9BSK0 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MARVELD1Q9BSK0 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MARVELD1Q9BSK0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MARVELD1Q9BSK0 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MARVELD1Q9BSK0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MARVELD1Q9BSK0 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MARVELD1Q9BSK0 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MARVELD1Q9BSK0 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MARVELD1Q9BSK0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MARVELD1Q9BSK0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MARVELD1Q9BSK0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MARVELD1Q9BSK0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MARVELD1Q9BSK0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MARVELD1Q9BSK0 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MARVELD1Q9BSK0 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MARVELD1Q9BSK0 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MARVELD1Q9BSK0 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MARVELD1Q9BSK0 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MARVELD1Q9BSK0 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MARVELD1Q9BSK0 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MARVELD1Q9BSK0 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MARVELD1Q9BSK0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MARVELD1Q9BSK0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
MARVELD1Q9BSK0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MARVELD1Q9BSK0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MARVELD1Q9BSK0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
MARVELD1Q9BSK0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MARVELD1Q9BSK0 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MARVELD1Q9BSK0 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MARVELD1Q9BSK0 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MARVELD1Q9BSK0 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MARVELD1Q9BSK0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MARVELD1Q9BSK0 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MARVELD1Q9BSK0 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MARVELD1Q9BSK0 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MARVELD1Q9BSK0 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MARVELD1Q9BSK0 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MARVELD1Q9BSK0 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MARVELD1Q9BSK0 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MARVELD1Q9BSK0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MARVELD1Q9BSK0 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MARVELD1Q9BSK0 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MARVELD1Q9BSK0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MARVELD1Q9BSK0 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MARVELD1Q9BSK0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MARVELD1Q9BSK0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MARVELD1Q9BSK0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MARVELD1Q9BSK0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MARVELD1Q9BSK0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MARVELD1Q9BSK0 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MARVELD1Q9BSK0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MARVELD1Q9BSK0 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MARVELD1Q9BSK0 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MARVELD1Q9BSK0 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MARVELD1Q9BSK0 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MARVELD1Q9BSK0 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MARVELD1Q9BSK0 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MARVELD1Q9BSK0 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MARVELD1Q9BSK0 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MARVELD1Q9BSK0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MARVELD1Q9BSK0 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MARVELD1Q9BSK0 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MARVELD1Q9BSK0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MARVELD1Q9BSK0 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MARVELD1Q9BSK0 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MARVELD1Q9BSK0 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MARVELD1Q9BSK0 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MARVELD1Q9BSK0 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MARVELD1Q9BSK0 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MARVELD1Q9BSK0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MARVELD1Q9BSK0 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MARVELD1Q9BSK0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MARVELD1Q9BSK0 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MARVELD1Q9BSK0 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MARVELD1Q9BSK0 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MARVELD1Q9BSK0 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MARVELD1Q9BSK0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MARVELD1Q9BSK0 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MARVELD1Q9BSK0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MARVELD1Q9BSK0 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MARVELD1Q9BSK0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MARVELD1Q9BSK0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
MARVELD1Q9BSK0 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
MARVELD1Q9BSK0 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MARVELD1Q9BSK0 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MARVELD1Q9BSK0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MARVELD1Q9BSK0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MARVELD1Q9BSK0 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MARVELD1Q9BSK0 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MARVELD1Q9BSK0 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MARVELD1Q9BSK0 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MARVELD1Q9BSK0 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MARVELD1Q9BSK0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MARVELD1Q9BSK0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MARVELD1Q9BSK0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
MARVELD1Q9BSK0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MARVELD1Q9BSK0 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MARVELD1Q9BSK0 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms