Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL6

SRSF8, Serine/arginine-rich splicing factor 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF8Q9BRL6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SRSF8Q9BRL6 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SRSF8Q9BRL6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SRSF8Q9BRL6 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SRSF8Q9BRL6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SRSF8Q9BRL6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SRSF8Q9BRL6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF8Q9BRL6 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF8Q9BRL6 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF8Q9BRL6 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF8Q9BRL6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF8Q9BRL6 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF8Q9BRL6 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF8Q9BRL6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF8Q9BRL6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF8Q9BRL6 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF8Q9BRL6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF8Q9BRL6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF8Q9BRL6 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF8Q9BRL6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF8Q9BRL6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF8Q9BRL6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF8Q9BRL6 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF8Q9BRL6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF8Q9BRL6 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF8Q9BRL6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF8Q9BRL6 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF8Q9BRL6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF8Q9BRL6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF8Q9BRL6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF8Q9BRL6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF8Q9BRL6 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF8Q9BRL6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF8Q9BRL6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF8Q9BRL6 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF8Q9BRL6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF8Q9BRL6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF8Q9BRL6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF8Q9BRL6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF8Q9BRL6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF8Q9BRL6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF8Q9BRL6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF8Q9BRL6 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF8Q9BRL6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF8Q9BRL6 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF8Q9BRL6 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF8Q9BRL6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF8Q9BRL6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF8Q9BRL6 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF8Q9BRL6 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF8Q9BRL6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF8Q9BRL6 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF8Q9BRL6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF8Q9BRL6 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF8Q9BRL6 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF8Q9BRL6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF8Q9BRL6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF8Q9BRL6 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF8Q9BRL6 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF8Q9BRL6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF8Q9BRL6 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF8Q9BRL6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF8Q9BRL6 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF8Q9BRL6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF8Q9BRL6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF8Q9BRL6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF8Q9BRL6 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF8Q9BRL6 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF8Q9BRL6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF8Q9BRL6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms