Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ3

GORASP1, Golgi reassembly-stacking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GORASP1Q9BQQ3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GORASP1Q9BQQ3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GORASP1Q9BQQ3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GORASP1Q9BQQ3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GORASP1Q9BQQ3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GORASP1Q9BQQ3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GORASP1Q9BQQ3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GORASP1Q9BQQ3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GORASP1Q9BQQ3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GORASP1Q9BQQ3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GORASP1Q9BQQ3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GORASP1Q9BQQ3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GORASP1Q9BQQ3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GORASP1Q9BQQ3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GORASP1Q9BQQ3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GORASP1Q9BQQ3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GORASP1Q9BQQ3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GORASP1Q9BQQ3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GORASP1Q9BQQ3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GORASP1Q9BQQ3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GORASP1Q9BQQ3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GORASP1Q9BQQ3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GORASP1Q9BQQ3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GORASP1Q9BQQ3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GORASP1Q9BQQ3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GORASP1Q9BQQ3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GORASP1Q9BQQ3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GORASP1Q9BQQ3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GORASP1Q9BQQ3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GORASP1Q9BQQ3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GORASP1Q9BQQ3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GORASP1Q9BQQ3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GORASP1Q9BQQ3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GORASP1Q9BQQ3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GORASP1Q9BQQ3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GORASP1Q9BQQ3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GORASP1Q9BQQ3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GORASP1Q9BQQ3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GORASP1Q9BQQ3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GORASP1Q9BQQ3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GORASP1Q9BQQ3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GORASP1Q9BQQ3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GORASP1Q9BQQ3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GORASP1Q9BQQ3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GORASP1Q9BQQ3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GORASP1Q9BQQ3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GORASP1Q9BQQ3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GORASP1Q9BQQ3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GORASP1Q9BQQ3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GORASP1Q9BQQ3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GORASP1Q9BQQ3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GORASP1Q9BQQ3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GORASP1Q9BQQ3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GORASP1Q9BQQ3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GORASP1Q9BQQ3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GORASP1Q9BQQ3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GORASP1Q9BQQ3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GORASP1Q9BQQ3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GORASP1Q9BQQ3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GORASP1Q9BQQ3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GORASP1Q9BQQ3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GORASP1Q9BQQ3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GORASP1Q9BQQ3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GORASP1Q9BQQ3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GORASP1Q9BQQ3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GORASP1Q9BQQ3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GORASP1Q9BQQ3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GORASP1Q9BQQ3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GORASP1Q9BQQ3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GORASP1Q9BQQ3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GORASP1Q9BQQ3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GORASP1Q9BQQ3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GORASP1Q9BQQ3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GORASP1Q9BQQ3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GORASP1Q9BQQ3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GORASP1Q9BQQ3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GORASP1Q9BQQ3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GORASP1Q9BQQ3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GORASP1Q9BQQ3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GORASP1Q9BQQ3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GORASP1Q9BQQ3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GORASP1Q9BQQ3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GORASP1Q9BQQ3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1
GORASP1Q9BQQ3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GORASP1Q9BQQ3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
GORASP1Q9BQQ3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GORASP1Q9BQQ3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GORASP1Q9BQQ3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GORASP1Q9BQQ3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GORASP1Q9BQQ3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GORASP1Q9BQQ3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GORASP1Q9BQQ3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GORASP1Q9BQQ3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GORASP1Q9BQQ3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GORASP1Q9BQQ3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GORASP1Q9BQQ3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GORASP1Q9BQQ3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GORASP1Q9BQQ3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GORASP1Q9BQQ3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GORASP1Q9BQQ3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms