Protein–RNA interactions for Protein: Q99456

KRT12, Keratin, type I cytoskeletal 12, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT12Q99456 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms