Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CRBNQ96SW2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CRBNQ96SW2 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CRBNQ96SW2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CRBNQ96SW2 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CRBNQ96SW2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CRBNQ96SW2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CRBNQ96SW2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CRBNQ96SW2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CRBNQ96SW2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CRBNQ96SW2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CRBNQ96SW2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CRBNQ96SW2 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CRBNQ96SW2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CRBNQ96SW2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CRBNQ96SW2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CRBNQ96SW2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CRBNQ96SW2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CRBNQ96SW2 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CRBNQ96SW2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CRBNQ96SW2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CRBNQ96SW2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CRBNQ96SW2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CRBNQ96SW2 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CRBNQ96SW2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CRBNQ96SW2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CRBNQ96SW2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CRBNQ96SW2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CRBNQ96SW2 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CRBNQ96SW2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CRBNQ96SW2 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CRBNQ96SW2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CRBNQ96SW2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CRBNQ96SW2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CRBNQ96SW2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CRBNQ96SW2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CRBNQ96SW2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CRBNQ96SW2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CRBNQ96SW2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CRBNQ96SW2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CRBNQ96SW2 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CRBNQ96SW2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CRBNQ96SW2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CRBNQ96SW2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CRBNQ96SW2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CRBNQ96SW2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CRBNQ96SW2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CRBNQ96SW2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CRBNQ96SW2 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CRBNQ96SW2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CRBNQ96SW2 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CRBNQ96SW2 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CRBNQ96SW2 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CRBNQ96SW2 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CRBNQ96SW2 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CRBNQ96SW2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CRBNQ96SW2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CRBNQ96SW2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CRBNQ96SW2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CRBNQ96SW2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CRBNQ96SW2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CRBNQ96SW2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CRBNQ96SW2 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CRBNQ96SW2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CRBNQ96SW2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CRBNQ96SW2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CRBNQ96SW2 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CRBNQ96SW2 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CRBNQ96SW2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CRBNQ96SW2 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CRBNQ96SW2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CRBNQ96SW2 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CRBNQ96SW2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CRBNQ96SW2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CRBNQ96SW2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CRBNQ96SW2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CRBNQ96SW2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CRBNQ96SW2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CRBNQ96SW2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CRBNQ96SW2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CRBNQ96SW2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CRBNQ96SW2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CRBNQ96SW2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CRBNQ96SW2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CRBNQ96SW2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CRBNQ96SW2 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CRBNQ96SW2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CRBNQ96SW2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CRBNQ96SW2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CRBNQ96SW2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CRBNQ96SW2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CRBNQ96SW2 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CRBNQ96SW2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CRBNQ96SW2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CRBNQ96SW2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CRBNQ96SW2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CRBNQ96SW2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CRBNQ96SW2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CRBNQ96SW2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CRBNQ96SW2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms