Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB3IPQ96QF0 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms