Protein–RNA interactions for Protein: Q96P48

ARAP1, Arf-GAP with Rho-GAP domain, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARAP1Q96P48 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
ARAP1Q96P48 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
ARAP1Q96P48 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
ARAP1Q96P48 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
ARAP1Q96P48 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
ARAP1Q96P48 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
ARAP1Q96P48 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
ARAP1Q96P48 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
ARAP1Q96P48 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
ARAP1Q96P48 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
ARAP1Q96P48 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
ARAP1Q96P48 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
ARAP1Q96P48 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
ARAP1Q96P48 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC34.48■■■■□ 3.11
ARAP1Q96P48 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
ARAP1Q96P48 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
ARAP1Q96P48 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
ARAP1Q96P48 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
ARAP1Q96P48 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
ARAP1Q96P48 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
ARAP1Q96P48 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
ARAP1Q96P48 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
ARAP1Q96P48 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.47■■■■□ 3.11
ARAP1Q96P48 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
ARAP1Q96P48 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
ARAP1Q96P48 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
ARAP1Q96P48 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
ARAP1Q96P48 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
ARAP1Q96P48 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
ARAP1Q96P48 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
ARAP1Q96P48 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
ARAP1Q96P48 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
ARAP1Q96P48 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
ARAP1Q96P48 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
ARAP1Q96P48 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
ARAP1Q96P48 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
ARAP1Q96P48 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
ARAP1Q96P48 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
ARAP1Q96P48 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC34.45■■■■□ 3.1
ARAP1Q96P48 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
ARAP1Q96P48 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
ARAP1Q96P48 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
ARAP1Q96P48 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
ARAP1Q96P48 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
ARAP1Q96P48 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
ARAP1Q96P48 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
ARAP1Q96P48 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
ARAP1Q96P48 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
ARAP1Q96P48 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
ARAP1Q96P48 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
ARAP1Q96P48 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
ARAP1Q96P48 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
ARAP1Q96P48 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
ARAP1Q96P48 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
ARAP1Q96P48 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
ARAP1Q96P48 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
ARAP1Q96P48 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
ARAP1Q96P48 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
ARAP1Q96P48 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC34.43■■■■□ 3.1
ARAP1Q96P48 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
ARAP1Q96P48 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
ARAP1Q96P48 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
ARAP1Q96P48 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
ARAP1Q96P48 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
ARAP1Q96P48 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
ARAP1Q96P48 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
ARAP1Q96P48 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
ARAP1Q96P48 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
ARAP1Q96P48 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
ARAP1Q96P48 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
ARAP1Q96P48 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
ARAP1Q96P48 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
ARAP1Q96P48 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
ARAP1Q96P48 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC34.42■■■■□ 3.1
ARAP1Q96P48 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
ARAP1Q96P48 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
ARAP1Q96P48 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
ARAP1Q96P48 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
ARAP1Q96P48 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
ARAP1Q96P48 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
ARAP1Q96P48 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
ARAP1Q96P48 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
ARAP1Q96P48 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC34.4■■■■□ 3.1
ARAP1Q96P48 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
ARAP1Q96P48 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
ARAP1Q96P48 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
ARAP1Q96P48 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
ARAP1Q96P48 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
ARAP1Q96P48 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
ARAP1Q96P48 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
ARAP1Q96P48 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
ARAP1Q96P48 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
ARAP1Q96P48 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
ARAP1Q96P48 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
ARAP1Q96P48 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
ARAP1Q96P48 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
ARAP1Q96P48 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
ARAP1Q96P48 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
ARAP1Q96P48 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
ARAP1Q96P48 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms