Protein–RNA interactions for Protein: Q96NG5

ZNF558, Zinc finger protein 558, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF558Q96NG5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF558Q96NG5 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF558Q96NG5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF558Q96NG5 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF558Q96NG5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF558Q96NG5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF558Q96NG5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF558Q96NG5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF558Q96NG5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF558Q96NG5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF558Q96NG5 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF558Q96NG5 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF558Q96NG5 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF558Q96NG5 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF558Q96NG5 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF558Q96NG5 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF558Q96NG5 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF558Q96NG5 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF558Q96NG5 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF558Q96NG5 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF558Q96NG5 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF558Q96NG5 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF558Q96NG5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF558Q96NG5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF558Q96NG5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF558Q96NG5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF558Q96NG5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF558Q96NG5 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF558Q96NG5 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF558Q96NG5 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF558Q96NG5 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF558Q96NG5 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF558Q96NG5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF558Q96NG5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF558Q96NG5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF558Q96NG5 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF558Q96NG5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF558Q96NG5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF558Q96NG5 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF558Q96NG5 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF558Q96NG5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF558Q96NG5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF558Q96NG5 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF558Q96NG5 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF558Q96NG5 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF558Q96NG5 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF558Q96NG5 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF558Q96NG5 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF558Q96NG5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF558Q96NG5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF558Q96NG5 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF558Q96NG5 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF558Q96NG5 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF558Q96NG5 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF558Q96NG5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF558Q96NG5 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF558Q96NG5 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF558Q96NG5 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF558Q96NG5 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF558Q96NG5 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF558Q96NG5 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF558Q96NG5 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF558Q96NG5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF558Q96NG5 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF558Q96NG5 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF558Q96NG5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF558Q96NG5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF558Q96NG5 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF558Q96NG5 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF558Q96NG5 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF558Q96NG5 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF558Q96NG5 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF558Q96NG5 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF558Q96NG5 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF558Q96NG5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF558Q96NG5 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF558Q96NG5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF558Q96NG5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF558Q96NG5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF558Q96NG5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF558Q96NG5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF558Q96NG5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF558Q96NG5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF558Q96NG5 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF558Q96NG5 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF558Q96NG5 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF558Q96NG5 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF558Q96NG5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF558Q96NG5 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms