Protein–RNA interactions for Protein: Q96N28

PRELID3A, PRELI domain containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID3AQ96N28 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRELID3AQ96N28 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRELID3AQ96N28 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRELID3AQ96N28 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRELID3AQ96N28 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRELID3AQ96N28 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRELID3AQ96N28 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRELID3AQ96N28 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRELID3AQ96N28 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRELID3AQ96N28 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRELID3AQ96N28 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRELID3AQ96N28 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRELID3AQ96N28 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRELID3AQ96N28 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRELID3AQ96N28 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRELID3AQ96N28 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRELID3AQ96N28 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRELID3AQ96N28 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRELID3AQ96N28 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms