Protein–RNA interactions for Protein: Q96MN9

ZNF488, Zinc finger protein 488, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF488Q96MN9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF488Q96MN9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms