Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG8

PCMTD1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMTD1Q96MG8 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCMTD1Q96MG8 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms