Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms