Protein–RNA interactions for Protein: Q96KK3

KCNS1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS1Q96KK3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNS1Q96KK3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNS1Q96KK3 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNS1Q96KK3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNS1Q96KK3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNS1Q96KK3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNS1Q96KK3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNS1Q96KK3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNS1Q96KK3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNS1Q96KK3 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNS1Q96KK3 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNS1Q96KK3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNS1Q96KK3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNS1Q96KK3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNS1Q96KK3 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNS1Q96KK3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNS1Q96KK3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNS1Q96KK3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNS1Q96KK3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNS1Q96KK3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNS1Q96KK3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNS1Q96KK3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNS1Q96KK3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNS1Q96KK3 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNS1Q96KK3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNS1Q96KK3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNS1Q96KK3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNS1Q96KK3 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms