Protein–RNA interactions for Protein: Q96HF1

SFRP2, Secreted frizzled-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP2Q96HF1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SFRP2Q96HF1 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms