Protein–RNA interactions for Protein: Q96DU9

PABPC5, Polyadenylate-binding protein 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC5Q96DU9 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PABPC5Q96DU9 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PABPC5Q96DU9 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PABPC5Q96DU9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PABPC5Q96DU9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PABPC5Q96DU9 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PABPC5Q96DU9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PABPC5Q96DU9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PABPC5Q96DU9 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PABPC5Q96DU9 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PABPC5Q96DU9 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PABPC5Q96DU9 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PABPC5Q96DU9 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PABPC5Q96DU9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PABPC5Q96DU9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PABPC5Q96DU9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PABPC5Q96DU9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PABPC5Q96DU9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PABPC5Q96DU9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PABPC5Q96DU9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PABPC5Q96DU9 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PABPC5Q96DU9 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PABPC5Q96DU9 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PABPC5Q96DU9 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PABPC5Q96DU9 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PABPC5Q96DU9 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PABPC5Q96DU9 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PABPC5Q96DU9 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PABPC5Q96DU9 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PABPC5Q96DU9 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PABPC5Q96DU9 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PABPC5Q96DU9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PABPC5Q96DU9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PABPC5Q96DU9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PABPC5Q96DU9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PABPC5Q96DU9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PABPC5Q96DU9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PABPC5Q96DU9 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PABPC5Q96DU9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PABPC5Q96DU9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PABPC5Q96DU9 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PABPC5Q96DU9 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PABPC5Q96DU9 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PABPC5Q96DU9 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PABPC5Q96DU9 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PABPC5Q96DU9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PABPC5Q96DU9 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PABPC5Q96DU9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PABPC5Q96DU9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PABPC5Q96DU9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PABPC5Q96DU9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PABPC5Q96DU9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PABPC5Q96DU9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PABPC5Q96DU9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PABPC5Q96DU9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PABPC5Q96DU9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms