Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM1

PGBD4, PiggyBac transposable element-derived protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD4Q96DM1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGBD4Q96DM1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGBD4Q96DM1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGBD4Q96DM1 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGBD4Q96DM1 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGBD4Q96DM1 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGBD4Q96DM1 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGBD4Q96DM1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGBD4Q96DM1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGBD4Q96DM1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGBD4Q96DM1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGBD4Q96DM1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGBD4Q96DM1 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGBD4Q96DM1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PGBD4Q96DM1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGBD4Q96DM1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PGBD4Q96DM1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGBD4Q96DM1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGBD4Q96DM1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGBD4Q96DM1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGBD4Q96DM1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGBD4Q96DM1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PGBD4Q96DM1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGBD4Q96DM1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PGBD4Q96DM1 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PGBD4Q96DM1 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGBD4Q96DM1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGBD4Q96DM1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGBD4Q96DM1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGBD4Q96DM1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGBD4Q96DM1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGBD4Q96DM1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGBD4Q96DM1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGBD4Q96DM1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGBD4Q96DM1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGBD4Q96DM1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PGBD4Q96DM1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PGBD4Q96DM1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGBD4Q96DM1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGBD4Q96DM1 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGBD4Q96DM1 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PGBD4Q96DM1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGBD4Q96DM1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGBD4Q96DM1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PGBD4Q96DM1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGBD4Q96DM1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGBD4Q96DM1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGBD4Q96DM1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PGBD4Q96DM1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGBD4Q96DM1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PGBD4Q96DM1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGBD4Q96DM1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGBD4Q96DM1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGBD4Q96DM1 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGBD4Q96DM1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGBD4Q96DM1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGBD4Q96DM1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PGBD4Q96DM1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PGBD4Q96DM1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PGBD4Q96DM1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PGBD4Q96DM1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGBD4Q96DM1 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms