Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC11Q96DB2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
HDAC11Q96DB2 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HDAC11Q96DB2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
HDAC11Q96DB2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC11Q96DB2 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC11Q96DB2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC11Q96DB2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC11Q96DB2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC11Q96DB2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC11Q96DB2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC11Q96DB2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC11Q96DB2 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC11Q96DB2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC11Q96DB2 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC11Q96DB2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC11Q96DB2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC11Q96DB2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC11Q96DB2 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC11Q96DB2 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC11Q96DB2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC11Q96DB2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC11Q96DB2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC11Q96DB2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC11Q96DB2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC11Q96DB2 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC11Q96DB2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC11Q96DB2 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC11Q96DB2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC11Q96DB2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC11Q96DB2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC11Q96DB2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC11Q96DB2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC11Q96DB2 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms