Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAF2Q96CS3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAF2Q96CS3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAF2Q96CS3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAF2Q96CS3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAF2Q96CS3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAF2Q96CS3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAF2Q96CS3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAF2Q96CS3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAF2Q96CS3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAF2Q96CS3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAF2Q96CS3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAF2Q96CS3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAF2Q96CS3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAF2Q96CS3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAF2Q96CS3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAF2Q96CS3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAF2Q96CS3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAF2Q96CS3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAF2Q96CS3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAF2Q96CS3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAF2Q96CS3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAF2Q96CS3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAF2Q96CS3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAF2Q96CS3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAF2Q96CS3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAF2Q96CS3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAF2Q96CS3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAF2Q96CS3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAF2Q96CS3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAF2Q96CS3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAF2Q96CS3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAF2Q96CS3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAF2Q96CS3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAF2Q96CS3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAF2Q96CS3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAF2Q96CS3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAF2Q96CS3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAF2Q96CS3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAF2Q96CS3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAF2Q96CS3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAF2Q96CS3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAF2Q96CS3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
FAF2Q96CS3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAF2Q96CS3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAF2Q96CS3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAF2Q96CS3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAF2Q96CS3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAF2Q96CS3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAF2Q96CS3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAF2Q96CS3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAF2Q96CS3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAF2Q96CS3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAF2Q96CS3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAF2Q96CS3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAF2Q96CS3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAF2Q96CS3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
FAF2Q96CS3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAF2Q96CS3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAF2Q96CS3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAF2Q96CS3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
FAF2Q96CS3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAF2Q96CS3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAF2Q96CS3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
FAF2Q96CS3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
FAF2Q96CS3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
FAF2Q96CS3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAF2Q96CS3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAF2Q96CS3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAF2Q96CS3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
FAF2Q96CS3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAF2Q96CS3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAF2Q96CS3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAF2Q96CS3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAF2Q96CS3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAF2Q96CS3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAF2Q96CS3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAF2Q96CS3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAF2Q96CS3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAF2Q96CS3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAF2Q96CS3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAF2Q96CS3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
FAF2Q96CS3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAF2Q96CS3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
FAF2Q96CS3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAF2Q96CS3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAF2Q96CS3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAF2Q96CS3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAF2Q96CS3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAF2Q96CS3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAF2Q96CS3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAF2Q96CS3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAF2Q96CS3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAF2Q96CS3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAF2Q96CS3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAF2Q96CS3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAF2Q96CS3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAF2Q96CS3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAF2Q96CS3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAF2Q96CS3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms