Protein–RNA interactions for Protein: Q96AG4

LRRC59, Leucine-rich repeat-containing protein 59, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC59Q96AG4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LRRC59Q96AG4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LRRC59Q96AG4 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LRRC59Q96AG4 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LRRC59Q96AG4 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LRRC59Q96AG4 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LRRC59Q96AG4 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LRRC59Q96AG4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRC59Q96AG4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRC59Q96AG4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRC59Q96AG4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRC59Q96AG4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRC59Q96AG4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRC59Q96AG4 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRC59Q96AG4 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRC59Q96AG4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRC59Q96AG4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRC59Q96AG4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRC59Q96AG4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LRRC59Q96AG4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LRRC59Q96AG4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LRRC59Q96AG4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LRRC59Q96AG4 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
LRRC59Q96AG4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LRRC59Q96AG4 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LRRC59Q96AG4 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LRRC59Q96AG4 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
LRRC59Q96AG4 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LRRC59Q96AG4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LRRC59Q96AG4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC59Q96AG4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC59Q96AG4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC59Q96AG4 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC59Q96AG4 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC59Q96AG4 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC59Q96AG4 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC59Q96AG4 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC59Q96AG4 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC59Q96AG4 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC59Q96AG4 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC59Q96AG4 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC59Q96AG4 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC59Q96AG4 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC59Q96AG4 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC59Q96AG4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC59Q96AG4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC59Q96AG4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC59Q96AG4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC59Q96AG4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC59Q96AG4 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC59Q96AG4 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LRRC59Q96AG4 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LRRC59Q96AG4 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LRRC59Q96AG4 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
LRRC59Q96AG4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LRRC59Q96AG4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LRRC59Q96AG4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRRC59Q96AG4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRRC59Q96AG4 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
LRRC59Q96AG4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRRC59Q96AG4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRRC59Q96AG4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRRC59Q96AG4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
LRRC59Q96AG4 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LRRC59Q96AG4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LRRC59Q96AG4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LRRC59Q96AG4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LRRC59Q96AG4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LRRC59Q96AG4 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LRRC59Q96AG4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LRRC59Q96AG4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LRRC59Q96AG4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LRRC59Q96AG4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LRRC59Q96AG4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LRRC59Q96AG4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LRRC59Q96AG4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LRRC59Q96AG4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LRRC59Q96AG4 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LRRC59Q96AG4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LRRC59Q96AG4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LRRC59Q96AG4 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LRRC59Q96AG4 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LRRC59Q96AG4 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LRRC59Q96AG4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LRRC59Q96AG4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LRRC59Q96AG4 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LRRC59Q96AG4 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LRRC59Q96AG4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LRRC59Q96AG4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LRRC59Q96AG4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LRRC59Q96AG4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRRC59Q96AG4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRRC59Q96AG4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRRC59Q96AG4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRRC59Q96AG4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
LRRC59Q96AG4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRRC59Q96AG4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRRC59Q96AG4 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRRC59Q96AG4 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRRC59Q96AG4 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms