Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPTSSAQ969W0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms