Protein–RNA interactions for Protein: Q969G6

RFK, Riboflavin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFKQ969G6 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RFKQ969G6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms