Protein–RNA interactions for Protein: Q92854

SEMA4D, Semaphorin-4D, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4DQ92854 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA4DQ92854 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA4DQ92854 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA4DQ92854 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA4DQ92854 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA4DQ92854 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA4DQ92854 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA4DQ92854 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA4DQ92854 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA4DQ92854 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA4DQ92854 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA4DQ92854 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA4DQ92854 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA4DQ92854 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA4DQ92854 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA4DQ92854 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA4DQ92854 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA4DQ92854 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA4DQ92854 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA4DQ92854 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA4DQ92854 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA4DQ92854 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA4DQ92854 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA4DQ92854 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SEMA4DQ92854 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SEMA4DQ92854 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SEMA4DQ92854 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SEMA4DQ92854 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SEMA4DQ92854 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SEMA4DQ92854 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SEMA4DQ92854 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA4DQ92854 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA4DQ92854 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA4DQ92854 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA4DQ92854 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA4DQ92854 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA4DQ92854 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA4DQ92854 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA4DQ92854 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA4DQ92854 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA4DQ92854 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA4DQ92854 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA4DQ92854 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA4DQ92854 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA4DQ92854 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA4DQ92854 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA4DQ92854 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA4DQ92854 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA4DQ92854 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA4DQ92854 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA4DQ92854 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA4DQ92854 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA4DQ92854 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA4DQ92854 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA4DQ92854 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA4DQ92854 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA4DQ92854 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA4DQ92854 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA4DQ92854 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA4DQ92854 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA4DQ92854 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA4DQ92854 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA4DQ92854 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA4DQ92854 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA4DQ92854 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA4DQ92854 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA4DQ92854 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA4DQ92854 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA4DQ92854 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA4DQ92854 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA4DQ92854 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA4DQ92854 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA4DQ92854 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA4DQ92854 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA4DQ92854 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA4DQ92854 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA4DQ92854 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA4DQ92854 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA4DQ92854 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA4DQ92854 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA4DQ92854 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA4DQ92854 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA4DQ92854 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA4DQ92854 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA4DQ92854 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA4DQ92854 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA4DQ92854 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA4DQ92854 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA4DQ92854 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA4DQ92854 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA4DQ92854 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA4DQ92854 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA4DQ92854 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA4DQ92854 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA4DQ92854 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA4DQ92854 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA4DQ92854 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA4DQ92854 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA4DQ92854 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA4DQ92854 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms