Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EDAQ92838 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EDAQ92838 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EDAQ92838 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EDAQ92838 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EDAQ92838 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EDAQ92838 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EDAQ92838 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EDAQ92838 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EDAQ92838 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EDAQ92838 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EDAQ92838 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EDAQ92838 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
EDAQ92838 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EDAQ92838 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EDAQ92838 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EDAQ92838 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EDAQ92838 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EDAQ92838 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EDAQ92838 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EDAQ92838 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EDAQ92838 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EDAQ92838 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
EDAQ92838 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
EDAQ92838 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EDAQ92838 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EDAQ92838 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EDAQ92838 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EDAQ92838 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EDAQ92838 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EDAQ92838 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EDAQ92838 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EDAQ92838 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EDAQ92838 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
EDAQ92838 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EDAQ92838 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EDAQ92838 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
EDAQ92838 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EDAQ92838 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EDAQ92838 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
EDAQ92838 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EDAQ92838 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EDAQ92838 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EDAQ92838 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EDAQ92838 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EDAQ92838 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EDAQ92838 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EDAQ92838 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EDAQ92838 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EDAQ92838 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EDAQ92838 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EDAQ92838 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EDAQ92838 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EDAQ92838 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EDAQ92838 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
EDAQ92838 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EDAQ92838 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EDAQ92838 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EDAQ92838 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EDAQ92838 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EDAQ92838 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EDAQ92838 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EDAQ92838 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EDAQ92838 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
EDAQ92838 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EDAQ92838 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EDAQ92838 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
EDAQ92838 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EDAQ92838 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EDAQ92838 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EDAQ92838 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EDAQ92838 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EDAQ92838 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EDAQ92838 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDAQ92838 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDAQ92838 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDAQ92838 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDAQ92838 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDAQ92838 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDAQ92838 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDAQ92838 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDAQ92838 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
EDAQ92838 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDAQ92838 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDAQ92838 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDAQ92838 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDAQ92838 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDAQ92838 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
EDAQ92838 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
EDAQ92838 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDAQ92838 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EDAQ92838 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EDAQ92838 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EDAQ92838 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EDAQ92838 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EDAQ92838 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
EDAQ92838 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EDAQ92838 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EDAQ92838 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EDAQ92838 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms