Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DNAAF4Q8WXU2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DNAAF4Q8WXU2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DNAAF4Q8WXU2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DNAAF4Q8WXU2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DNAAF4Q8WXU2 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DNAAF4Q8WXU2 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DNAAF4Q8WXU2 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DNAAF4Q8WXU2 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DNAAF4Q8WXU2 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
DNAAF4Q8WXU2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DNAAF4Q8WXU2 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DNAAF4Q8WXU2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DNAAF4Q8WXU2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DNAAF4Q8WXU2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DNAAF4Q8WXU2 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DNAAF4Q8WXU2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DNAAF4Q8WXU2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DNAAF4Q8WXU2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DNAAF4Q8WXU2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DNAAF4Q8WXU2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DNAAF4Q8WXU2 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DNAAF4Q8WXU2 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DNAAF4Q8WXU2 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DNAAF4Q8WXU2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DNAAF4Q8WXU2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DNAAF4Q8WXU2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DNAAF4Q8WXU2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DNAAF4Q8WXU2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DNAAF4Q8WXU2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DNAAF4Q8WXU2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DNAAF4Q8WXU2 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DNAAF4Q8WXU2 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DNAAF4Q8WXU2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DNAAF4Q8WXU2 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DNAAF4Q8WXU2 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
DNAAF4Q8WXU2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DNAAF4Q8WXU2 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DNAAF4Q8WXU2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DNAAF4Q8WXU2 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DNAAF4Q8WXU2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DNAAF4Q8WXU2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DNAAF4Q8WXU2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DNAAF4Q8WXU2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DNAAF4Q8WXU2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DNAAF4Q8WXU2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DNAAF4Q8WXU2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DNAAF4Q8WXU2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DNAAF4Q8WXU2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DNAAF4Q8WXU2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DNAAF4Q8WXU2 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DNAAF4Q8WXU2 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
DNAAF4Q8WXU2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DNAAF4Q8WXU2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DNAAF4Q8WXU2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DNAAF4Q8WXU2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DNAAF4Q8WXU2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
DNAAF4Q8WXU2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DNAAF4Q8WXU2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DNAAF4Q8WXU2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DNAAF4Q8WXU2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DNAAF4Q8WXU2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DNAAF4Q8WXU2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DNAAF4Q8WXU2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DNAAF4Q8WXU2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DNAAF4Q8WXU2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DNAAF4Q8WXU2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
DNAAF4Q8WXU2 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DNAAF4Q8WXU2 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
DNAAF4Q8WXU2 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
DNAAF4Q8WXU2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DNAAF4Q8WXU2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DNAAF4Q8WXU2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DNAAF4Q8WXU2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
DNAAF4Q8WXU2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
DNAAF4Q8WXU2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DNAAF4Q8WXU2 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DNAAF4Q8WXU2 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
DNAAF4Q8WXU2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DNAAF4Q8WXU2 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DNAAF4Q8WXU2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DNAAF4Q8WXU2 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DNAAF4Q8WXU2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DNAAF4Q8WXU2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DNAAF4Q8WXU2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DNAAF4Q8WXU2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DNAAF4Q8WXU2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DNAAF4Q8WXU2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DNAAF4Q8WXU2 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
DNAAF4Q8WXU2 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DNAAF4Q8WXU2 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DNAAF4Q8WXU2 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
DNAAF4Q8WXU2 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DNAAF4Q8WXU2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DNAAF4Q8WXU2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DNAAF4Q8WXU2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DNAAF4Q8WXU2 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DNAAF4Q8WXU2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DNAAF4Q8WXU2 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DNAAF4Q8WXU2 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms