Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PIK3C3Q8NEB9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms