Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC83Q8IWF9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC83Q8IWF9 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC83Q8IWF9 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC83Q8IWF9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC83Q8IWF9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC83Q8IWF9 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC83Q8IWF9 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC83Q8IWF9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC83Q8IWF9 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC83Q8IWF9 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC83Q8IWF9 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC83Q8IWF9 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC83Q8IWF9 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC83Q8IWF9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC83Q8IWF9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC83Q8IWF9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC83Q8IWF9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC83Q8IWF9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC83Q8IWF9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC83Q8IWF9 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC83Q8IWF9 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC83Q8IWF9 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC83Q8IWF9 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC83Q8IWF9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC83Q8IWF9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC83Q8IWF9 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC83Q8IWF9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC83Q8IWF9 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC83Q8IWF9 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC83Q8IWF9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC83Q8IWF9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC83Q8IWF9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC83Q8IWF9 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC83Q8IWF9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC83Q8IWF9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC83Q8IWF9 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC83Q8IWF9 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC83Q8IWF9 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC83Q8IWF9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC83Q8IWF9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC83Q8IWF9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC83Q8IWF9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC83Q8IWF9 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC83Q8IWF9 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC83Q8IWF9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC83Q8IWF9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC83Q8IWF9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC83Q8IWF9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC83Q8IWF9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC83Q8IWF9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC83Q8IWF9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC83Q8IWF9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC83Q8IWF9 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC83Q8IWF9 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC83Q8IWF9 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC83Q8IWF9 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC83Q8IWF9 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC83Q8IWF9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC83Q8IWF9 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC83Q8IWF9 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC83Q8IWF9 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC83Q8IWF9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC83Q8IWF9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC83Q8IWF9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC83Q8IWF9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC83Q8IWF9 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC83Q8IWF9 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC83Q8IWF9 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC83Q8IWF9 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC83Q8IWF9 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC83Q8IWF9 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC83Q8IWF9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC83Q8IWF9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC83Q8IWF9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC83Q8IWF9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC83Q8IWF9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC83Q8IWF9 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC83Q8IWF9 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC83Q8IWF9 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC83Q8IWF9 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC83Q8IWF9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC83Q8IWF9 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC83Q8IWF9 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC83Q8IWF9 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC83Q8IWF9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC83Q8IWF9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC83Q8IWF9 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC83Q8IWF9 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC83Q8IWF9 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC83Q8IWF9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC83Q8IWF9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC83Q8IWF9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC83Q8IWF9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC83Q8IWF9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC83Q8IWF9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC83Q8IWF9 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC83Q8IWF9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC83Q8IWF9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC83Q8IWF9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms